Certaines piscines biologiques emploient trois zones distinctes : une qui contient des roseaux ; la seconde qui possède des plantes plus attrayantes telles que des lis d'eau ; et la troisième est employée pour la natation. Dans chaque zone, l'eau est pompée par l'intermédiaire de bondes de fond. Les plantes se développent dans un gravier, qui est un "substrat" sans aliment, les forçant à prendre leurs aliments dans l'eau, ce qui contribue au processus de nettoyage. Des skimmers sont employées pour rassembler la matière organique telle que des feuilles.

Certains skimmers sont fort appréciés des animaux. Vous pouvez voir une grenouille sauter en soulevant le couvercle. Cependant, il faut admettre que les piscines biologiques ne sont pas pour tout le monde, particulièrement ceux qui n'aiment pas voir la nature de trop près. Vous ne pouvez pas obtenir la perfection dans une piscine biologique. Si vous voulez la perfection, préférez une piscine chlorée. Et si vous ne voulez pas nager avec les grenouilles ou les crapauds, oubliez la piscine naturelle. Mais pour se reposer et observer des martins-pêcheurs et des libellules sur l'eau, le côté de la piscine biologique est magique. Vous n'obtenez pas cela avec une piscine chlorée.